Chùa Vĩnh Nghiêm tương truyền được xây dựng từ thời Lý – Trần và có vai trò vô cùng quan trọng đối với sự hình thành và phát triển của Phật giáo Việt Nam, thiền phái Trúc lâm Yên Tử. Hiện nay, Thủ tưởng Chính phủ cũng đang chỉ đạo tỉnh Bắc Giang và Quảng Ninh phối hợp xây dựng Hồ sơ đệ trình UNESCO ghi danh Quần thể Di tích - Danh thắng Yên Tử là Di sản Văn hóa Thế giới.
Theo Quyết định, Thủ tướng Chính phủ yêu cầu Bộ trưởng Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch; Chủ tịch Ủy ban Nhân dân các cấp nơi có bảo vật quốc gia; các Bộ trưởng, Thủ trưởng cơ quan ngang bộ, cơ quan trực thuộc Chính phủ; người đứng đầu ngành, tổ chức được giao quản lý bảo vật quốc gia được công nhận nêu trên trong phạm vi nhiệm vụ và quyền hạn của mình thực hiện việc quản lý đối với bảo vật quốc gia theo quy định của pháp luật về di sản văn hóa.
Các di tích cùng được công nhận là di tích Quốc gia đặc biệt bao gồm: Di tích khảo cổ Hang Con Moong và các di tích phụ cận (tỉnh Thanh Hóa). Di tích khảo cổ Mộ Cự thạch Hàng Gòn (thị xã Long Khánh, tỉnh Đồng Nai). Di tích kiến trúc nghệ thuật Tháp Chăm Dương Long (huyện Tây Sơn, tỉnh Bình Định). Di tích kiến trúc nghệ thuật Tháp Bình Sơn (huyện Sông Lô, tỉnh Vĩnh Phúc). Di tích lịch sử và kiến trúc nghệ thuật Chùa Vĩnh Nghiêm (huyện Yên Dũng, tỉnh Bắc Giang). Di tích lịch sử và kiến trúc nghệ thuật Đền Trần Thương (huyện Lý Nhân, tỉnh Hà Nam). Di tích lịch sử Đền thờ Nguyễn Bỉnh Khiêm (huyện Vĩnh Bảo, thành phố Hải Phòng). Di tích lịch sử Chiến trường Điện Biên Phủ (thành phố Điện Biên Phủ, huyện Tuần Giáo và huyện Điện Biên, tỉnh Điện Biên). Di tích lịch sử Căn cứ Bộ Chỉ huy Quân giải phóng miền Nam Việt Nam (huyện Lộc Ninh, tỉnh Bình Phước). Di tích lịch sử Địa đạo Củ Chi (huyện Củ Chi, thành phố Hồ Chí Minh). Di tích lịch sử và danh lam thắng cảnh Tây Thiên - Tam Đảo (huyện Tam Đảo, tỉnh Vĩnh Phúc).
Việc chùa Vĩnh Nghiêm được công nhận là di tích Quốc gia đặc biệt sẽ tạo điều kiện thuận lợi để Bắc Giang tiếp tục đầu tư bảo tồn, khai thác phát huy giá trị di tích trong đời sống đương đại, trong đó có việc khai thác phục vụ phát triển Du lịch./.